หลักการทำงานของเครื่องโปรตีนบาร์ส่วนใหญ่รวมถึงการประมวลผลวัตถุดิบการขึ้นรูปแบบอัดขึ้นรูปการระบายความร้อนการตัดและการเคลือบ ประการแรกวัตถุดิบเช่นโปรตีนถั่วเหลืองสารให้ความหวานเม็ดสีและรสชาติผลไม้ผสมกันในสัดส่วนที่แน่นอนและปริมาณน้ำที่เหมาะสมจะถูกเติมลงในการผัดและผสมเพื่อสร้างส่วนผสมพื้นฐานที่สม่ำเสมอ จากนั้นส่วนผสมจะถูกส่งไปยังเครื่องอัดรีดสำหรับการปั้นแบบอัดขึ้นรูปซึ่งเป็นขั้นตอนกระบวนการหลักของเครื่องโปรตีนบาร์ ในโพรงของเครื่องอัดรีดวัตถุดิบจะถูกรีดและหมุนเพื่อสร้างรูปร่างและความดันของแถบโปรตีนเพื่อให้มั่นใจว่าผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้ายมีรสชาติที่ดีและมีความเสถียรคุณภาพ
แถบโปรตีนที่เกิดขึ้นจะต้องได้รับการเสริมความแข็งแกร่งผ่านอุโมงค์ระบายความร้อนเพื่อให้แน่ใจว่าน้ำเชื่อมและสารอื่น ๆ ภายในมีการแข็งตัวอย่างสมบูรณ์และให้ความแน่นเพียงพอ แถบโปรตีนระบายความร้อนจะถูกตัดเป็นแถบสี่เหลี่ยมที่เรียบร้อยโดยอุปกรณ์ตัด ในที่สุดแถบโปรตีนที่ถูกตัดผ่านอุปกรณ์เคลือบและพื้นผิวถูกปกคลุมด้วยชั้นของช็อคโกแลตหรือการเคลือบอื่น ๆ เพื่อสร้างผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย